研究領(lǐng)域:Fisher博士領(lǐng)導(dǎo)牛津大學(xué)靶點發(fā)現(xiàn)研究所蛋白組部。他的職業(yè)專長涵蓋了從基礎(chǔ)研究項目到臨床新藥物靶點和市場開發(fā)等合作工作,甚至還有古蛋白組。目前Fisher博士和他的團隊關(guān)注的是樣品準(zhǔn)備方法的篩選,以此來增強使用有限的臨床材料進行深度蛋白組研究靈敏度和效率。
挑戰(zhàn):培養(yǎng)細(xì)胞深度蛋白組是很容易獲得的。但是,從有限的生物材料-比如組織部分或某種表型的單個分離細(xì)胞(比如通過排列或激光捕獲,顯微切割)-中檢測到>2000蛋白質(zhì)還是相當(dāng)困難的,而后者相當(dāng)接近單細(xì)胞蛋白組。
他是如何解決這一困難:Fisher博士和他的團隊使用 Purkinje神經(jīng)元激光捕獲顯微切割,評估不同樣本準(zhǔn)備方法從少量細(xì)胞中辨識出最多蛋白的效率。蛋白微珠固定加上后續(xù)消化(SP3方法)獲得的可識別蛋白數(shù)量最多,比標(biāo)準(zhǔn)溶液內(nèi)消化、FASP和iST方法都要多。
好結(jié)果:SP3方法能夠大約從200個Purkinje細(xì)胞中檢測出>2500蛋白質(zhì)。團隊通過把這種方法和串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)簽(TMT)試劑和初步組分分離相結(jié)合,預(yù)期能夠從一個樣本中對不同腦細(xì)胞類型進行深度蛋白質(zhì)檢測和定量分析,從而在細(xì)胞精度水平上獲得空間蛋白分析結(jié)果。