近年來(lái)的調(diào)查和定性反饋結(jié)果表明,研究人員對(duì)當(dāng)前的cDNA合成結(jié)果并不滿意,同時(shí)他們也不得不檢測(cè)越來(lái)越多的困難樣本,如含有抑制劑的純化不佳RNA,或已降解的RNA。為了解困難樣本反轉(zhuǎn)錄的效能問(wèn)題,我們?cè)诙喾N抑制劑存在的條件下,將SSIV VILO與其他市售的cDNA合成試劑盒進(jìn)行了RT效率的比較。按照以下公式,以SSIV VILO反應(yīng)的Ct?值對(duì)其他供應(yīng)商的試劑盒所生成的Ct?值進(jìn)行歸一化計(jì)算:歸一化的Y值?= [1/2^(Ct SSIV VILO?-Ct 供應(yīng)商?x)]。如圖3A所示,無(wú)論是否存在抑制劑,SSIV VILO在所有cDNA合成試劑盒中都表現(xiàn)出最高的反應(yīng)效率。與此類(lèi)似,SSIV VILO還在冷凍樣本(圖3B)和FFPE樣本(圖3C)的cDNA合成反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)了更高的效能。
圖3A.SSIV VILO與其他8款市售預(yù)混液之間的比較。使用100 ng Hela總RNA,在20 μL RT反應(yīng)體系(加入或不加指定濃度的抑制劑)中進(jìn)行RT反應(yīng)。在10 μL qPCR反應(yīng)體系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和B2M基因靶點(diǎn)的TaqMan引物/探針評(píng)估qPCR的反應(yīng)效能。
圖3B.在20 μL RT反應(yīng)體系中,使用50 ng冷凍組織的RNA樣本進(jìn)行RT反應(yīng),并對(duì)SSIV VILO與其他5款市售的預(yù)混液產(chǎn)品的反應(yīng)效果進(jìn)行比較。在10 μL qPCR反應(yīng)體系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和基因靶向TaqMan引物/探針評(píng)估qPCR的反應(yīng)性能。
圖3C.在20 μL RT反應(yīng)體系中使用50 ng FFPE的RNA樣本進(jìn)行RT反應(yīng),并對(duì)SSIV VILO與其他4款市售的預(yù)混液產(chǎn)品進(jìn)行比較。使用EXPRESS qPCR SuperMix,以10 μL反應(yīng)體系和基因靶點(diǎn)針對(duì)性的TaqMan引物/探針評(píng)估qPCR的反應(yīng)性能。